《忍者神龟：斯普林特的命运》斯普林特被抓走。大脚帮正在进攻。纽约市一片混乱！进入斯普林特命运的战斗-调整-再入传送门循环，把事情弄个水落石出。

当斯普林特被施瑞德绑架后，整个纽约市同时出现了很多神秘的传送门。为了寻找线索，艾普和金属头对抢回的神器加以分析，乌龟们则展开奋战，誓要从大脚帮的魔掌中救回他们的父亲。然而，随着大伙儿距离斯普林特所处的异界位置越来越近，一个更大的威胁却从阴影之中浮现出来……